主角建次与自己的父亲原本生活在史前时代,遇到了补捉时空怪兽的邪恶女王一行人与时空怪兽爱爱,后来跟和父亲被邪恶女王变成化石流传到25世纪的日本,被双胞胎姐弟小柔与阿时发现,之后被时空王国的国王变回原形,奉时空管理局之命,抓回因为时空王国被攻击而流落到各个时空的时空怪兽。